Índices são uma das partes fundamentais do Magento 2, problemas como preços não atualizados e grids de pedidos/clientes desatualizadas no backend podem estar ocorrendo devido a algum problema na regeneração dos índices.
Para consultar o status dos índices utilize o comando a seguir:
php bin/magento indexer:status
Caso você encontre o status “suspended” é por que ocorreu algum erro critico no momento da atualização deste índice.
Imaginando que o índice de Categoria dos produtos (catalog_product_category) está com o status de suspenso, para que o mesmo seja normalizado execute:
php bin/magento indexer:reset catalog_product_category
php bin/magento indexer:reindex catalog_product_category
É importante que você rastreie nos logs por erros para que o problema não se repita.